邢琼课题组简介

一、 研究方向

课题组立足于病源微生物致病分子机器的结构基础和分子机制的研究。综合运用结构生物学、计算生物学和常规生物化学生物物理的方法，在不同分辨率水平，探究病源微生物致病机器的组装、调控、运行和功能机制。围绕以上内容，课题组主要分为以下几个研究方向：

1. 革兰氏阴性细菌鞭毛的组装和运动调控的分子基础

革兰氏阴性细菌通过鞭毛实现趋利避害的运动功能和宿主细胞识别定植的粘附功能。鞭毛组织是一个由30种左右不同蛋白组成的巨型蛋白质纳米机器，该机器从组成蛋白序列、组成蛋白结构、鞭毛亚结构到鞭毛结构不同层次都高度保守，是细菌最为重要的“器官”之一。研究细菌的鞭毛组装和运动的分子机制，是揭示生物体内蛋白质纳米机器组装和功能行使的重要基础。由于鞭毛对于细菌自身繁殖的非必要性以及对于细菌感染宿主的必要性，从而针对于鞭毛的药物不易产生抗生素抗性，因而鞭毛组织是开发新型抗生素的最有潜力的靶点之一。

2. 细菌效应蛋白与宿主靶细胞的相互作用。

在长期的进化过程中，病源细菌与宿主都发展出了一系列“相爱相杀”“相互克制和互相成就”的攻防体系，这也是目前很多病源细菌都是机会型病原菌和临时型益（共）生菌的原因，在宿主强大的时候相安无事，在宿主脆弱的时候揭竿而起。这些攻防体系的背后，是复杂的细菌效应蛋白与宿主免疫系统相关蛋白之间的角力。从而探究效应蛋白与宿主之间的互作，是从分子层次揭示病原菌致病机理的关键，也是认识我们自身免疫体系的重要方法。

二、 团队成员

邢琼，教授、团队负责人、博士生导师,湖北省百人计划创新人才.2010年7月，华中科技大学，生命科学与技术学院，获理学学士学位，2015年7月，中国科学院武汉数学与物理研究所，分析化学博士，2015-10至2017-07，美国明尼苏达大学，生物化学与生物物理学，博士后2017-07至2020-01，美国St.Jude儿童研究医院，结构生物学，博士后。2020年入职湖北大学。研究领域包括液体核磁共振波谱学、冷冻电子显微镜单颗粒蛋白质结构生物学、微生物蛋白纳米机器、生物催化与酶改造等。近年来参与国家重点项目一项，在Nature Communications，Angewandte Chemie，eLife等杂志发表论文10篇。Email:qiongxingnmr@hubu.edu.cn。

三、 承担的科研项目

1. 国家重点研发计划子课题：工业酶的智能设计与催化应用(2021YFC2100100)

四、 发表论文

1. Yang, J., Wang, F., Yang, S., Jiang, W., Gao, R., Lin, S., Deng, B., Wang, X., Cheng, W., Liu, Y., Chen, C., Xing, Q., Zhai, C., & Ma, L. (2022). Development of a Hyperthermostable Artificial Scaffold Based on Ultrahigh-Affinity Protein Pairs and Its Application in Cellulose Degradation. ACS Sustainable Chemistry & Engineering.

2. Zhang X, Hu Y, Peng W, Gao C, Xing Q*, Wang B*, Li A*. Exploring the Potential of Cytochrome P450 CYP109B1 Catalyzed Regio-and Stereoselective Steroid Hydroxylation. Front Chem. 2021 Feb 18;9:649000. doi: 10.3389/fchem.2021.649000. PMID: 33681151; PMCID: PMC7930613.

3. Chen Y, Xu W, Yu S, Ni K, She G, Ye X, Xing Q*, Zhao J*, Huang C*. Assembly status transition offers an avenue for activity modulation of a supramolecular enzyme. Elife. 2021 Dec 13;10:e72535. doi: 10.7554/eLife.72535. PMID: 34898426; PMCID: PMC8668187.

4. Xing Qiong; Shi Ke; Portaliou Athina; Rossi Paolo; Economou Anastassios; Kalodimos Charalampos*; Structures of chaperone-substrate complexes docked onto the export gate in a type III secretion system, Nature Communications, 2018, 9:1773.

5. Xing Qiong#; Huang Peng#; Yang Ju; Sun Jian‐Qiang; Gong Zhou; Dong Xu; Guo Da‐Chuan; Chen Shao‐Min; Yang Yu‐Hong; Wang Yan; Yang Ming‐Hui; Yi Ming; Ding Yi‐Ming; Liu Mai‐Li; Zhang Wei‐Ping#*; Tang Chun*; Visualizing an ultra-weak protein-protein interaction in phosphorylation signaling, Angewandte Chemie-International Edition, 2014, 53:11501-11505.

6. Monneau Yoan#; Rossi Paolo#*; Bhaumik Anusarka; Huang Chengdong; Jiang Yajun; Saleh Tamjeed; Xie Tao; Xing Qiong; Kalodimos Charalampos*; Automatic methyl assignment in large proteins by the MAGIC algorithm, Journal of Biomolecular NMR, 2017, 69: 215-227.

7. Zhao Bing#; Zhang Meng#; Han Xue; Zhang Xia-Yan; Xing Qiong; Dong Xu; Shi Qiao-Juan; Huang Peng; Lu Yun-Bi; Wei Er-Qing; Xia Qiang; Zhang Wei-Ping*; Tang Chun; Cerebral ischemia is exacerbated by extracellular nicotinamide phosphoribosyltransferase via a non-enzymatic mechanism, PloS one, 2013, 8: e85403.

8. Liu Zhu; Zhang Wei-Ping; Xing Qiong; Ren Xuefeng; Liu Maili; Tang Chun*; Noncovalent dimerization of ubiquitin, Angewandte Chemie-International Edition, 2012, 51: 469-472.

9. Xing Qiong, Paolo Rossi and Charalampos Kalodimos. Structural basis of hierarchical protein secretion Type III secretion system. 28th International Council on Magnetic Resonance in Biological Systems, Dublin, Ireland.

10. Eric Warren, Xing Qiong, Paolo Rossi and Charalampos Kalodimos. Interactions of Bacterial Type III Secretion ATPase FliI with FliJ. 28th International Council on Magnetic Resonance in Biological Systems, Dublin, Ireland.