一、基本信息

杨世辉，博士，教授，博士生导师

电子邮件：Shihui.Yang@hubu.edu.cn

研究领域：微生物系统与合成生物学以及绿色生物制造

二、教育背景

2000.09－2005.05 美国加州大学河滨分校，博士

1997.09－2000.06 武汉大学，硕士

1989.09－1993.06 湖北大学，学士

三、工作经历

2016.08 －至今 湖北大学

2011.02－2016.08 美国国家可再生能源实验室国家生物能源中心

2007.02－2011.02 美国能源部橡树岭国家实验室生物能源科学中心

2005.05－2007.02 威斯康星大学密尔沃基分校生物学系博士后

四、主持科研项目

1. 工业菌株重编程优化及应用，科技部，国家重点研发计划“合成生物学”重点专项，2022-2026，项目负责人

2. 运动发酵单胞菌葡萄糖代谢产乳酸与乙醇碳分流机制的研究，国家自然科学基金，面上项目，2020年1月-2023年12月

3. DNA修复系统影响运动发酵单胞菌辐射敏感性分子机制的研究，国家自然科学基金，联合基金项目，2020年1月-2022年12月

4. 绿色生物制造关键酶的设计与应用，湖北省科技厅，重大科技创新计划，2021-2023

5. 秸秆类资源生产生物能源产品关键技术研究，湖北省科技厅，湖北省技术创新专项（对外科技合作类），2019-2021

五、代表性论文（^#第一作者; *通讯作者）

1. Yan X^#, Bao W^#, Wu Y^#, Zhang C, Mao Z, Yuan Q, Hu Z, He P, Peng Q, Hu M, Geng B, Ma H, Chen S, Fei Q*, He Q*, Yang S*. Paradigm of engineering recalcitrant non-model microorganism with dominant metabolic pathway as a biorefinery chassis. Nat Commun. 2024, 15(1):10441.

2. Binan G^#, Yalun W^#, Xinyan W^#, Yongfu Y, Peng Z, Yunhaon C, Xuan Z, Chenguang L, Fengwu B, Ping X, Qiaoning H*, Shihui Y*. Efficient genome-editing tools to engineer the recalcitrant non-model industrial microorganism Zymomonas mobilis. Trends Biotechnol. 2024, 42(11):1551-1575.

3. Li, Y.; Wang, Y.; Wang, R.; Yan, X.; Wang, J.; Wang, X.; Chen, S.; Bai, F.; He, Q.*; Yang, S*. Metabolic engineering of Zymomonas mobilis for continuous co-production of bioethanol and poly-3-hydroxybutyrate (PHB). Green Chem 2022, 24 (6):2588-2601.

4. Zheng Y, Han J, Wang B, Hu X, Li R, Shen W, Ma X, Ma L, Yi L, Yang S, Peng W. Characterization and repurposing of the endogenous Type I-F CRISPR-Cas system of Zymomonas mobilis for genome engineering. Nucleic Acids Res. 2019 Dec 2;47(21):11461-11475.

5. Yang S, Land ML, Klingeman DM, Pelletier DA, Lu TY, Martin SL, Guo HB, Smith JC, Brown SD*. Paradigm for industrial strain improvement identifies sodium acetate tolerance loci in Zymomonas mobilis and Saccharomyces cerevisiae. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Jun 8;107(23):10395-400.

6. Yang S, Pappas KM, Hauser LJ, Land ML, Chen GL, Hurst GB, Pan C, Kouvelis VN, Typas MA, Pelletier DA, Klingeman DM, Chang YJ, Samatova NF, Brown SD*. Improved genome annotation for Zymomonas mobilis. Nat Biotechnol. 2009 Oct;27(10):893-4.

六、申请与授权专利（部分）

1. Yang, S., Yan, X, Li, M., Wang, X., He, Q. US12,098,410 B1. 2024. Recombinant Zymomonas mobilis for producing ethylene glycol, method and uses thereof.

2. Yang, S., Wang, Y, Chen, Y., Chen, Y., He, Q. US20230287398A1. 2023. Construction method of a tight regulation system for gene expression in Zymomonas mobilis and applications.

3. Yang, S., Yang, Y, Shen, W., Li, R., Huang, J, Wang, Y., Yi, L, and Ma, L. US11248258B2. 2022. Methods for characterizing biological parts based on dual-fluorescent reporter gene system and biological part library constructed thereon.

4. 杨世辉、胡蜜蜜、何桥宁、李勉. CN202310447119.2. 2024. 利用无机氮源的运动发酵单胞菌、应用及氮代谢调控基因.

5. 杨世辉，伍欣艳，耿碧男. 2022110278592. 消除质粒、质粒组合、基因编辑试剂盒、制备方法及应用, 发明专利.

6. 杨世辉、耿碧男、刘淑宜. 2022115722804. 毒素基因及其在重组和或基因编辑的工程菌构建中的应用, 发明专利.  

7. 杨世辉、何桥宁、李扬. ZL2021116463342. 一种生产PHB的自絮凝运动发酵单胞菌的构建方法及其应用. 2022年11月1日, 发明专利。

8. 杨世辉， 彭文舫， 郑艳丽， 易犁， 马立新. ZL201910692143.6.一种基于运动发酵单胞菌內 CRISPR-Cas系统的基因组编辑方法及其应用. 2021年7月19日, 发明专利。

9. 杨世辉，沈威，杨永富，黄钜，易犁，马立新. ZL201910114635.7.一种基于双荧光报告基因系统鉴定生物元件的方法. 2021年7月2日, 发明专利。

10. 杨世辉，沈威， 彭文舫， 马立新. ZL2019106921120. 一种基于CRISPR-Cas12a系统的运动发酵单胞菌基因组编辑方法及其应用. 2021年5月17日, 发明专利。

七、荣誉及奖励

2024年6月 中国发明协会2024年度“发明创业奖”人物奖

2021年 湖北大学第二届“我心目中的好导师”“十佳”研究生导师

2018~2024 中国国际大学生创新大赛国赛银奖、互联网+湖北省金奖、宜昌市宜起创一等奖、国际基因工程机器大赛（iGEM）金奖与银奖等奖项指导老师