余希岚 博士,教授
XiLan Yu,Professor
电子邮件: yuxilan@hubu.edu.cn
一、基本信息
余希岚,教授,博士研究生导师
研究领域:表观遗传学、糖代谢、基因表达调控
研究方向:糖代谢通路、糖酵解酶和代谢产物与表观遗传修饰在衰老与肿瘤中的作用。
糖酵解是生物体最重要且最保守的生命代谢活动之一,在细胞生长、分化以及疾病发生发展等方面具有非常重要的作用。糖酵解酶及代谢产物可转运到细胞核里,参与调控基因表达、DNA复制等与代谢无关的生物学过程。本课题组从基因表达调控角度,深入研究了糖代谢感知通路、糖酵解酶和代谢产物调控细胞衰老和肿瘤发生发展的表观遗传机制。
1、发现组蛋白乙酰转移酶复合物SAGA可感知外界葡萄糖的变化,揭示了其调控基因表达的新机制,阐明了细胞适应外界环境压力的新方式(Nat Struct Mol Biol 2022; BBA-Gene Regul Mech 2020)。
2、发现丙酮酸激酶复合物SESAME通过催化组蛋白磷酸化调控基因表达与维持端粒结构,揭示了糖酵解酶调控细胞衰老的表观遗传机制,为开发抗衰老药物提供了新靶点(Nat Commun 2021; Nat Metab 2021; Oncogene 2017; Front Genet 2018)。
3、发现糖代谢产物丙酮酸抑制组蛋白基因表达,揭示了其抑制肿瘤生长的分子机制,阐明了糖代谢产物调控染色体结构的新机制(Nucleic Acids Res 2019; J Genet Genomics 2019; Front Cell Dev Biol 2021)。
这些研究不仅加深了对糖酵解调控基因表达与组蛋白修饰的认识,为理解糖酵解在细胞衰老和肿瘤发生发展中的作用机理提供了重要的理论基础,并且为开发抗衰老和抗肿瘤药物提供了理论依据和重要线索。
二、教育背景
2007.08–2013.05 美国爱荷华州立大学,遗传学,博士
2001.09–2005.06 华中农业大学,生命科学技术学院生物技术专业,学士
三、工作经历
2015.09 至今 湖北大学生命科学学院,讲师、副教授、教授
2014.05–2015.05 美国斯托瓦斯医学研究所,生物化学,博士后
2013.05–2014.05 美国爱荷华州立大学,微生物学,研究助理
四、科研项目
1. 国家自然科学基金(31872812):SAGA 催化的 Ada3 乙酰化调控基因表达的机制研究;经费:72 万元;2019.01–2022.12,主持人。
2. 国家自然科学基金(31600046):丁香假单胞菌海藻糖合成与抗水分胁迫相关性研究;经费:24 万元;2017.01–2019.12,主持人。
3. 湖北省自然科学基金“杰出青年” 项目(2019CFA077):丙酮酸激酶 PKM2 调控血管细胞衰老的表观遗传机制研究;经费:20 万元;2019.09–2022.09,主持人。
4. 湖北省 “青年百人计划” 配套经费,2017.07–2020.07,主持人。
5. 湖北省自然科学基金(2016CFB103):丙酮酸激酶复合体(SESAME)对端粒异染色质形成以及细胞衰老的影响;经费:5 万元;2016.01–2017.12,主持人。
6. 美国国立卫生院基金(2008-35600-18786):Analysis of metazoan SAGA complex function in gene expression;经费:120 万美元;2012.01–2016.12,已结题,参与。
7. 美国农业部基金(MCB-0920156):Functional Genomics of the Epiphytic and Pathogenic Lifestyles of the Bacterial Plant Pathogen Pseudomonas syringae;经费:90 万美元;2008.01–2012.12,已结题,参与。
8. 美国国家自然科学基金(GM099945-01):Cellular responses to quaternary ammonium compounds by Pseudomonas syringae that influence its interactions with plants;经费:58 万美元;2010.01-2012.12,已结题,参与。
五、代表性论文
1. Xilan Yu, Shanshan Li*. Specific regulation of epigenome landscape by metabolic enzymes and metabolites. Biological Reviews, 2024, 99(3):878-900.
2. Xin Li#, Shanshan Wang#, Xilan Yu*, Shanshan Li*. Transcriptional regulation of autophagy by chromatin remodeling complex and histone variant, Autophagy, 2023, 1-3.
3. Fei He#, Qi Yu#, Min Wang, Rongsha Wang, Xuanyunjing Gong, Feng Ge, Xilan Yu*, Shanshan Li*. SESAME-catalyzed H3T11 phosphorylation inhibits Dot1-catalyzed H3K79me3 to regulate autophagy and telomere silencing. Nature Communications, 2022, 13: 7526.
4. Junhua Huang#, Wenjing Dai#, Duncheng Xiao, Qian Xiong, Feng Ge, Xilan Yu*, Shanshan Li*. Acetylation-dependent dimerization of SAGA complex promotes nucleosome acetylation and gene transcription. Nature Structural & Molecular Biology, 2022, 29(3):261-273.
5. Qi Yu#, Xuanyunjing Gong#, Yue Tong, Min Wang, Kai Duan, Xinyu Zhang, Feng Ge, Xilan Yu*, Shanshan Li*. Phosphorylation of Jhd2 by the Ras-cAMP-PKA(Tpk2) pathway regulates histone modifications and autophagy. Nature Communications, 2022, 13: 5675.
6. Wanping Chen#, Xilan Yu#, Yinsheng Wu, Qi Yu, Xiaodong Lv, Zitong Zha, Bicheng Hu, Xin Li, Jianguo Chen, Lixin Ma, Jerry L. Workman, Shanshan Li*. The SESAME complex regulates cell senescence through the generation of acetyl-CoA. Nature Metabolism, 2021, 3(7):983-1000.
7. Rui Ma#, Yinsheng Wu#, Shanshan Li*, Xilan Yu*. Interplay between glucose metabolism and chromatin modifications in cancer. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2021, 9:654337.
8. Shihao Zhang#, Xilan Yu#, Yuan Zhang, Xiangyan Xue, Qi Yu, Zitong Zha, Madelaine Gogol, Jerry L. Workman, Shanshan Li*. Metabolic regulation of telomere silencing by SESAME complex-catalyzed H3T11 phosphorylation. Nature Communications, 2021, 12(1):594.
9. Xuanyunjing Gong#, Qi Yu#, Kai Duan, Yue Tong, Xinyu Zhang, Qianyun Mei, Li Lu, Xilan Yu*, Shanshan Li*. Histone acetyltransferase Gcn5 regulates gene expression by promoting the transcription of histone methyltransferase SET1. BBA-Gene Regulatory Mechanisms, 2020, 1863(9):194603.
10. Rui Ma#, Yinsheng Wu#, Yansheng Zhai, Bicheng Hu, Wei Ma, Wenqiang Yang, Qi Yu, Zhen Chen, Jerry L. Workman, Xilan Yu*, Shanshan Li*. Exogenous pyruvate represses histone gene expression and inhibits cancer cell proliferation via the NAMPT-NAD+-SIRT1 pathway. Nucleic Acids Research, 2019, 47(21): 11132-11150.
11. Qianyun Mei, Chen Xu, Gogol Madelaine, Jie Tang, Wanping Chen, Xilan Yu, Jerry L. Workman*, Shanshan Li*. Set1-catalyzed H3K4 trimethylation antagonizes the HIR/Asf1/Rtt106 repressor complex to promote histone gene expression and chronological life span. Nucleic Acids Research, 2019, 47(7):3434-3449.
12. Yinsheng Wu#, Shihao Zhang#, Qi Yu#, Xuanyunjing Gong#, Mingdan Luo, Yuan Zhang, Jerry L. Workman, Xilan Yu*, Shanshan Li*. Glycolysis regulates gene expression by promoting the crosstalk between H3K4me3 and H3K14ac in Saccharomyces cerevisiae. Journal of Genetics and Genomics, 2019, 46(12):561-574.
13. Xilan Yu, Rui Ma, Yinsheng Wu, Yansheng Zhai, Shanshan Li*. Reciprocal regulation of metabolic reprogramming and epigenetic modifications in cancer. Frontiers in Genetics, 2018, 9:394.
14. Xilan Yu, Shanshan Li*. Non-metabolic functions of glycolytic enzymes in tumorigenesis. Oncogene, 2017, 36(19): 2629-2636.
15. Xilan Yu, Wuxiang Mao, Yansheng Zhai, Chong Tong, Min Liu, Lixin Ma, Xiaolan Yu, Shanshan Li*. Anti-tumor activity of metformin: from metabolic and epigenetic perspectives. Oncotarget, 2017, 8(3):5619-5628.
16. Xilan Yu, Steven P. Lund, Jessica W. Greenwald, Angela H. Records, Russell A. Scott, Dan Nettleton, Steven E. Lindow, Dennis C. Gross, Gwyn A. Beattie*. Transcriptional analysis of the global regulatory networks active in Pseudomonas syringae during leaf colonization. mBio, 2014, 5(5): e01683-14.
17. Xilan Yu, Steven P. Lund, Russell A. Scott, Jessica W. Greenwald, Angela H. Records, Dan Nettleton, Steven E. Lindow, Dennis C. Gross, Gwyn A. Beattie*. Transcriptional responses of Pseudomonas syringae to growth in epiphytic versus apoplastic leaf sites. Proc Natl Acad Sci U S A, 2013, 110(5): E425-E434.
六、获奖
1. 湖北大学“优秀教师”,2016-2018。
2. 湖北省“百人计划”,2017。
3. 第二届全国大学生生命科学创新创业大赛指导奖一等奖,2017。
4. 湖北大学突出业绩奖,2017-2019。
5. 湖北大学“优秀教师”,2018-2020。
6. 湖北省第六届大学生生物实验技能竞赛优秀指导教师奖,2019。
7. 教育部“青年长江学者”,2023。